Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbdP63072 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbdP63072 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbdP63072 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbdP63072 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms