Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms