Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms