Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abce1P61222 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abce1P61222 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms