Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3eP60229 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms