Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphp4P59240 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nphp4P59240 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nphp4P59240 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nphp4P59240 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nphp4P59240 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nphp4P59240 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms