Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl3P58873 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms