Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samsn1P57725 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms