Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms