Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms