Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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