Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irf5P56477 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irf5P56477 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irf5P56477 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irf5P56477 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms