Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms