Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolgP54099 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolgP54099 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolgP54099 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolgP54099 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PolgP54099 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms