Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fdft1P53798 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms