Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms