Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1cP52432 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1cP52432 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1cP52432 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1cP52432 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1cP52432 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms