Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CntfP51642 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfP51642 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfP51642 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms