Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Opn1swP51491 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1swP51491 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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