Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MipP51180 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MipP51180 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MipP51180 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MipP51180 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MipP51180 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms