Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa8P50706 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa8P50706 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms