Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa6P50704 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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