Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms