Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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