Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Elk3P41971 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Elk3P41971 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk3P41971 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms