Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CskP41241 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CskP41241 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CskP41241 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CskP41241 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CskP41241 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CskP41241 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CskP41241 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CskP41241 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms