Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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