Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ThpoP40226 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ThpoP40226 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ThpoP40226 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ThpoP40226 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms