Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprkP35822 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprkP35822 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprkP35822 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprkP35822 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms