Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab20P35295 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms