Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp12P34960 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp12P34960 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp12P34960 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp12P34960 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp12P34960 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp12P34960 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp12P34960 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp12P34960 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp12P34960 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp12P34960 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms