Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptk2P34152 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms