Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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