Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms