Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms