Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms