Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxraP28700 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxraP28700 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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