Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nckap1P28660 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms