Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms