Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms