Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms