Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BrafP28028 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BrafP28028 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BrafP28028 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BrafP28028 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms