Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms