Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms