Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra3P26049 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gabra3P26049 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra3P26049 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra3P26049 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra3P26049 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra3P26049 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra3P26049 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra3P26049 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra3P26049 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra3P26049 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra3P26049 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms