Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria2P23819 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria2P23819 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria2P23819 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms