Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms