Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou5f1P20263 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms