Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms