Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms